我国科研团队发布水稻完整参考基因组

作者: 来源: 科技日报 2023-08-24 11:35:14

 


【资料图】

水稻是重要的粮食作物,其基因组组装对水稻育种意义重大。23日,记者从中国农业科学院深圳农业基因组研究所获悉,该所联合崖州湾实验室、中国水稻研究所、中国农科院作物科学研究所和扬州大学等多个单位发布完整的水稻参考基因组,实现了全基因组所有染色体端粒到端粒无缺口组装,为水稻育种研究提供了新的有力工具和重要大数据基础。相关研究成果日前发表在《分子植物》(Molecular Plant)上。

2005年,水稻品种“日本晴”基因组草图发布,水稻研究正式跨入基因组学时代。

此后,“日本晴”参考基因组在2013年进一步更新,大幅改善了基因组组装结果和基因注释,成为水稻的标准参考基因组,一直沿用至今。然而,由于当时测序和组装技术限制,该基因组对复杂结构区域的组装存在占全长3%左右的缺口,这些缺口阻碍了水稻育种的研究进程。

论文通讯作者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员商连光介绍,为此,研究团队以水稻“日本晴”为材料,综合利用新一代测序技术,完成了“日本晴”参考基因组的完整组装,其大小为385.7百万碱基对,每条染色体的端粒到端粒均由一条完整连续的序列组成,碱基精确度超过99.9999%,最新的组装新增了12.5百万碱基对的基因组序列,主要解锁了水稻基因组中结构最为复杂的核糖体DNA序列、着丝粒区域、复杂转座子序列和端粒区域等,修正了多个由于缺口导致的基因结构错误,新增了1324个蛋白编码基因注释,该研究为水稻育种研究奠定了重要理论基础。

 

相关文章
最近更新
  • 我国科研团队发布水稻完整参考基因组

    我国科研团队发布水稻完整参考基因组

    2023-08-24

  • 粤港澳大湾区、上海都市圈上半年GDP成绩汇总:上海与香港齐回升

    粤港澳大湾区、上海都市圈上半年GDP成绩汇总:上海与香港齐回升

    2023-08-24

  • 新型骗局盯上了奶茶!已有人上当,聊天记录曝光

    新型骗局盯上了奶茶!已有人上当,聊天记录曝光

    2023-08-24

  • 水果飘香采摘忙

    水果飘香采摘忙

    2023-08-24

  • 成都耳鼻喉医院排名前十名(成都耳鼻喉)

    成都耳鼻喉医院排名前十名(成都耳鼻喉)

    2023-08-24

  • 华骐环保8月24日快速反弹

    华骐环保8月24日快速反弹

    2023-08-24

  • 股民提问天瑞仪器:公司有哪些产品可以对核污染物进行检测?

    股民提问天瑞仪器:公司有哪些产品可以对核污染物进行检测?

    2023-08-24

  • 守护青年时光,牢筑反诈屏障,稠州银行开展“反诈宣传进校园”活动

    守护青年时光,牢筑反诈屏障,稠州银行开展“反诈宣传进校园”活动

    2023-08-24

  • 外媒:美国查获超14亿美元被欺诈的新冠疫情救助资金

    外媒:美国查获超14亿美元被欺诈的新冠疫情救助资金

    2023-08-24

  • ao丰台税务“微蓝+”邀请涉税专业服务机构为民营企业释疑解惑

    ao丰台税务“微蓝+”邀请涉税专业服务机构为民营企业释疑解惑

    2023-08-24

  • 广州优眠:双向情感障碍,探秘情感波动的五大征兆

    广州优眠:双向情感障碍,探秘情感波动的五大征兆

    2023-08-24

  • 北京移动多举措助力防范电信网络诈骗显成效

    北京移动多举措助力防范电信网络诈骗显成效

    2023-08-24

  • 广青科技新钢种成功试制上线

    广青科技新钢种成功试制上线

    2023-08-24

  • 第三届院士青城行暨首府科创人才大会28日召开

    第三届院士青城行暨首府科创人才大会28日召开

    2023-08-24

  • 原创暑假,这5条摆烂建议送给焦虑的家长们

    原创暑假,这5条摆烂建议送给焦虑的家长们

    2023-08-24

  • 黑龙江前7个月新能源项目在建规模创历史新高

    黑龙江前7个月新能源项目在建规模创历史新高

    2023-08-24

  • A股继续震荡探底 环保板块逆势活跃

    A股继续震荡探底 环保板块逆势活跃

    2023-08-24

  • 前7个月中非贸易同比增长7.4%

    前7个月中非贸易同比增长7.4%

    2023-08-24

  • 400亿已抄底,还有援军!

    400亿已抄底,还有援军!

    2023-08-24

  • 量化优势加持增强指基 景顺长城国证2000指数增强正在发行

    量化优势加持增强指基 景顺长城国证2000指数增强正在发行

    2023-08-24

  • “科创中国”技术经纪人联盟助力山区长出生态产业链

    “科创中国”技术经纪人联盟助力山区长出生态产业链

    2023-08-24

  • 北京建城纪念柱之溯源与史话

    北京建城纪念柱之溯源与史话

    2023-08-24

  • 2023中国国际生态竞争力峰会即将在承德举办

    2023中国国际生态竞争力峰会即将在承德举办

    2023-08-24

  • 捷佳伟创08月23日获深股通增持45.23万股

    捷佳伟创08月23日获深股通增持45.23万股

    2023-08-24

  • 英伟达公布第二财季财报:净利润61.88亿美元 同比增长843%

    英伟达公布第二财季财报:净利润61.88亿美元 同比增长843%

    2023-08-24

  • 家电企业发力新能源寻找新“增长点”

    家电企业发力新能源寻找新“增长点”

    2023-08-24

  • A股投资者必看!煤气化股票龙头有哪些?(2023年8月)

    A股投资者必看!煤气化股票龙头有哪些?(2023年8月)

    2023-08-24

  • 北京亦庄建设机器人产业集聚区

    北京亦庄建设机器人产业集聚区

    2023-08-24

  • “研发+商业化”双引擎驱动下,如何看待兆科眼科-B(6622.HK)的潜力和价值?

    “研发+商业化”双引擎驱动下,如何看待兆科眼科-B(6622.HK)的潜力和价值?

    2023-08-24

  • 注册制改革激发新动能 创业板更好发挥资本市场枢纽功能

    注册制改革激发新动能 创业板更好发挥资本市场枢纽功能

    2023-08-24